Odliczenie VAT w okresie przejściowym KSeF – studium przypadku

Odliczenie VAT w okresie przejściowym KSeF – studium przypadku

19 czerwca, 2026
Krzysztof Niemiec

Istotne wnioski:

  • Format faktury (papierowy, PDF czy ustrukturyzowany KSeF) nie wpływa na prawo do odliczenia VAT – dokument musi zawierać wymagane dane oraz spełniać materialne warunki odliczenia określone w przepisach.
  • Faktury wystawione przed 1 lutego nie podlegają obowiązkowi przesyłania do Krajowego Systemu e-Faktur (KSeF) – podatnik rozlicza je na dotychczasowych zasadach.
  • Brak faktury w systemie KSeF (np. przy transakcjach poniżej 10 000 zł lub przy użyciu kasy fiskalnej) nie odbiera podatnikowi prawa do odliczenia VAT.
  • Brak konieczności korekt: Zgodnie z interpretacją z 30 marca 2026 r. (sygn. 0112-KDIL1-3.4012.67.2026.1.EO), podatnik nie musi korygować ewidencji o numer KSeF, jeśli sprzedawca spóźnił się z wdrożeniem systemu.

Okres przejściowy związany z KSeF trwa. Część przedsiębiorców dostosowała się jeszcze przed wejściem obowiązku, inni są w trakcie zmian, a niektórzy zakładają, że mają czas do końca roku. Sprawdźmy, z jakimi sytuacjami możesz się obecnie spotkać i czy wpływają one na prawo do odliczenia VAT.

Odliczenia VAT i zmiany związane z KSeF

KSeF to ogólnopolska platforma, która zmienia dotychczasowy obieg dokumentów księgowych w Polsce. Kwiecień to pierwszy miesiąc, w którym większość przedsiębiorców faktycznie musiała zmierzyć się z jego działaniem – zarówno po stronie wystawiania faktur, jak i pobierania dokumentów kosztowych.

W maju przychodzi moment ich rozliczenia, a wraz z nim pojawia się klasyczne pytanie: czy mogę odliczyć VAT z tego dokumentu?

Sytuacji nie upraszcza fakt, że na stacjach paliw nadal otrzymujesz wydruki, a część kontrahentów przesyła faktury e-mailem. Powstaje więc naturalna wątpliwość: jak to wszystko prawidłowo ująć?

Jakie są warunki odliczenia podatku VAT?

Podstawowe warunki niezbędne do odliczenia VAT to:

  1. Powstanie obowiązku podatkowego u sprzedawcy,
  2. Związek zakupu z czynnościami opodatkowanymi,
  3. Posiadanie faktury,
  4. Dokonanie odliczenia w okresie otrzymania faktury.

Przepisy nie uzależniają prawa do odliczenia od posiadania faktury ustrukturyzowanej. Ustawa definiuje fakturę jako dokument w postaci papierowej lub w postaci elektronicznej, zawierający dane wymagane ustawą i przepisami wydanymi na jej podstawie. Znaczenie mają zatem dane znajdujące się na dokumencie, a nie forma, w jakiej została ona (faktura) przesłana.

Jak rozliczyć fakturę wystawioną w styczniu, a przesłaną do KSeF w lutym?

To najprostszy przypadek. Faktury wystawione przed 1 lutego nie podlegały obowiązkowi przesyłania do KSeF. Nawet jeśli zostały tam później wprowadzone, nie zmienia to zasad ich rozliczenia.

Jeżeli otrzymałeś fakturę w styczniu (w formie papierowej lub PDF), prawo do odliczenia VAT powstało w rozliczeniu za styczeń. Późniejsze przesłanie jej do KSeF nie ma na to wpływu. Możesz, ale nie musisz jej uzupełnić.

Rozliczenie następuje więc w styczniu.

Jak rozliczyć fakturę wystawioną w marcu, a przesłaną do KSeF w kwietniu?

Załóżmy, że 31 marca kontrahent wystawia fakturę i przesyła ją e-mailem, a następnie dokument pojawia się również w KSeF.

W pierwszej kolejności sprawdź, czy jest to faktura ustrukturyzowana, np. poprzez obecność kodu QR. Jeśli tak, mogła zostać wystawiona w trybie offline i przesłana do systemu później (procedura offline24). Warto wtedy zweryfikować jej obecność w KSeF.

Jeżeli dokument nie zawiera kodu QR i wygląda jak standardowa faktura, jego otrzymanie w marcu daje prawo do odliczenia VAT za ten miesiąc.

W obu wariantach rozliczenie następuje w marcu.

Jak rozliczyć fakturę wystawioną w kwietniu, której nie ma w KSeF?

Możliwa jest również sytuacja, w której otrzymasz fakturę wystawioną w kwietniu, ale nie znajdziesz jej w KSeF.

Może to wynikać z dwóch przyczyn:

  1. Braku obowiązku przesyłania dokumentu do KSeF,
  2. Niedostosowania systemu sprzedawcy.

Najczęściej chodzi o pierwszy przypadek, w szczególności gdy:

  • faktura została wystawiona przy użyciu kasy fiskalnej (obowiązek KSeF nie dotyczy ich do końca 2026 roku),
  • sprzedawca nie przekroczył limitu 10 000 zł miesięcznej sprzedaży na rzecz przedsiębiorców.

W takich sytuacjach brak faktury w KSeF nie ma znaczenia – odliczenia dokonujesz na podstawie otrzymanego dokumentu.

Jeżeli natomiast sprzedawca nie dostosował się jeszcze do KSeF, również masz prawo do odliczenia VAT. Trzeba jednak pamiętać, że po wdrożeniu systemu może on przesłać do KSeF także wcześniejsze faktury. W takim przypadku możesz być wzywany do uzupełnienia ewidencji o numer KSeF. Jednak w interpretacji z dnia 30 marca 2026 roku sygn. 0112-KDIL1-3.4012.67.2026.1.EO wskazano, że nie masz obowiązku dokonywania korekty.

Podsumowanie

Jeżeli spełnione są materialne warunki odliczenia VAT, w szczególności posiadasz dokument zawierający wszystkie wymagane elementy faktury, możesz odliczyć podatek w okresie jego otrzymania. Potwierdzają to liczne interpretacje indywidualne (np. interpretacja z 25 marca 2026 r., sygn. 0112-KDIL1-1.4012.988.2025.2.WK.). Forma dokumentu – w tym brak jego obecności w KSeF – nie pozbawia Cię tego prawa.

Często zadawane pytania

Czy forma przesłania faktury (np. PDF zamiast KSeF) wpływa na prawo do odliczenia VAT?

Jak rozliczyć fakturę wystawioną offline przed KSeF i przesłaną do systemu później?

Co zrobić, gdy sprzedawca nie wystawił faktury w KSeF mimo takiego obowiązku?

Czy brak faktury w KSeF przy zakupie z kasy fiskalnej blokuje odliczenie VAT?

Krzysztof Niemiec
Doradca podatkowy (nr wpisu 12043). Wspiera biura rachunkowe, kancelarie prawne oraz przedsiębiorców w meandrach prawa podatkowego i w podejmowaniu bezpiecznych decyzji biznesowych, rozwijając swoją praktykę w ramach taxologia.pl. Łączy doświadczenie zdobyte w administracji skarbowej z doradztwem dla biznesu, pomagając firmom działać świadomie i minimalizować ryzyka podatkowe.
Artykuł przypadł Ci do gustu? Warto go podać dalej!
Ikona linku

Ostatnie wpisy

11 czerwca, 2026
Składki ZUS – ile zapłacisz? Kompleksowy przewodnik po zmianach w 2026 roku
Składki ZUS w 2026 roku biją rekordy – duży ZUS to już 1 926,77 zł miesięcznie. Sprawdź, ile zapłacisz na każdej formie ...
10 czerwca, 2026
PIT-36L (2025/2026): Kto i do kiedy składa PIT-36L? Kompletny poradnik
Podatek liniowy 19% wymaga rozliczenia na formularzu PIT-36L. Sprawdź, kto musi go złożyć, do kiedy, jakie limity i ulgi...
29 maja, 2026
Terminy podatkowe 2026 – do kiedy zapłacić VAT, PIT, CIT i ZUS?
Kalendarz to najważniejsze narzędzie przedsiębiorcy. Zebraliśmy wszystkie terminy podatkowe 2026 – VAT, PIT, CIT i ZUS –...